Ως Χειμερινό Σχολείο ορίζεται ένα εξειδικευμένο εντατικό εκπαιδευτικό πρόγραμμα που λειτουργεί τους μήνες Σεπτέμβριο με Μάιο. Τα Χειμερινά Σχολεία απευθύνονται σε προπτυχιακές/ούς και μεταπτυχιακές/ούς φοιτήτριες/ φοιτητές, υποψήφιες/ους διδακτόρισσες/διδάκτορες, επιστημόνισσες/επιστήμονες και ερευνήτριες/ερευνητές από την Ελλάδα και όλο τον κόσμο.

Η διάρκεια ενός Χειμερινού Σχολείου δεν μπορεί να είναι μικρότερη των 4 ημερών και 4 διδακτικών ωρών ημερησίως, ενώ σε κάθε περίπτωση δεν θα πρέπει να είναι μεγαλύτερη των 3 συνεχόμενων εβδομάδων. Σε περίπτωση που κριθεί απαραίτητο από την/τον Επιστημονικά Υπεύθυνη/ο του Χειμερινού Σχολείου μεγαλύτερη διάρκεια, δύναται να υποβληθεί τεκμηριωμένη πρόταση προς το συμβούλιο του Κέντρου.

Η λειτουργία ενός Χειμερινού Σχολείου θα πρέπει να διεξάγεται με κάθε διαθέσιμο εκπαιδευτικά τρόπο και «μέσο»: σεμινάρια, εργαστήρια, στρογγυλές τράπεζες, ομάδες εργασίας, δράσεις συμβουλευτικής καθοδήγησης, ασκήσεις πεδίου, εκπαιδευτικές εκδρομές ή επισκέψεις και άλλες διαδραστικές δραστηριότητες. Η επιλογή της γλώσσας διδασκαλίας συναρτάται αφενός με το διεθνή χαρακτήρα του εκάστοτε Χειμερινού Σχολείου και, αφετέρου, με το ειδικότερο αντικείμενο της διδασκαλίας.